萨迦派教主一直由昆氏家族世代相袭，血统、法统一脉相承。在萨迦始祖贡却杰布（公元1034～1102年）以前，昆氏家族世代信仰修行宁玛派的教法，并且有取得成就的人。
赤松德赞时期，大臣民拔窝伽的第三子昆氏鲁益旺波松（龙王护），是西藏最初被剃度为僧的“七觉士”之一，之后数传至贡却杰布。贡却杰布幼年跟从父兄先学宁玛派法，这个时候，后弘时期已经开始了几十年，藏族人重新翻译了大量佛典，所谓新密咒的传播正值兴盛，于是他改从卓弥译师释迦耶歇等人修习新译密法，而且以卓弥所传的“道果法”经续讲解为自己的主要教法。贡却杰布40岁时在萨迦地方建立萨迦寺，从此逐渐形成萨迦派，贡却杰布成为该派教主，住持弘法达30年之久。这一派一直以萨迦寺为其主寺，一直以“道果”教授为其主要密法传承。
萨迦派规定，僧人可以娶妻生子，生子后就不能再接近妇女；并从一开始就决定法位以家族相传的形式向下延续，所以政教两权都集中于昆氏家族手中。
◎觉域派
觉域派的显密教法有断除人们由于不能正确认识对象而生起的种种烦恼的果效，因此这个法门称作“觉域”。
觉域派之名，藏文写法有两种，一是觉域，二是决域。前一个觉域的“觉”，意谓他们的这种教法（主要指慈悲心、菩提心和空性见）能断除人生的苦恼及生死的根源，“域”即是“境”，所谓“境”，即是心理活动对象，该派佛教徒的观点是，一切烦恼均产生于我们对认识对象的误解和由此生发的爱憎。因而他们认为，用真正的智慧和一切人的慈悲心能够断除这些烦恼，也就是说，他们的显密教法有断除人们由于不能正确认识对象而生起的种种烦恼的果效，因此这个法门称作“觉域”。后一个决域的“决”，字面意义为“行”，是指有认识功能的精神方面对它所认识的对象的认识、权衡等活动，“决域”旧译为“所行境”，这里也就是说，他们称谓的般若空性见和慈悲心等等．对所认识的境界有把错讹的认识演化成真确的认识的果效，所以称作“决域”。